Mientras que el glioblastoma es un tumor cerebral muy agresivo que hoy en día deja pocas esperanzas de curación, investigadores han logrado identificar diferentes formas de este tumor y cartografiarlas con precisión analizando la actividad de los factores de regulación genética.
Estos nuevos datos abren el camino a un mejor manejo de este cáncer y al desarrollo de nuevos tratamientos más dirigidos.
El glioblastoma es el tumor cerebral más frecuente pero también el más agresivo. Cada año, se diagnostican aproximadamente 3500 nuevos casos en Francia. Hoy, a pesar de numerosos avances científicos, este tumor sigue siendo incurable debido a una fuerte heterogeneidad molecular y celular, que complica el uso de esquemas terapéuticos estándar.
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El problema es que cada tumor es particular: los genes expresados son numerosos y diferentes, formando una red compleja de interacciones. Nuestros trabajos revelan una jerarquía controlada por 'reguladores maestros' - moléculas clave hiperconectadas - que mantienen activamente el tumor", explica Mohamed Elati, jefe del equipo "Sistemas digitales & Cáncer Computacional" del laboratorio CANTHER en Lille.
Buscando categorizar los tumores para afinar los tratamientos, los científicos hasta ahora habían logrado identificar 4 subgrupos tumorales según los perfiles transcripcionales (expresión de genes) de los pacientes. Pero algunos grupos seguían siendo muy heterogéneos.
En este nuevo estudio, los investigadores se centraron en la actividad de moléculas reguladoras, los factores de transcripción, que interactúan con nuestros genes, activando o inhibiendo su expresión. De los 2375 factores de transcripción y cofactores presentes en humanos, 539 están activos en los mecanismos tumorales del glioblastoma.
Gracias a la IA y al machine learning en particular, los investigadores pudieron unificar datos de 16 estudios internacionales realizados durante varios años (aproximadamente 1600 pacientes). Este enfoque permitió establecer el mapa más grande hasta la fecha de la actividad transcripcional del glioblastoma, identificando esta vez hasta 7 subtipos de tumores, cada uno asociado a mecanismos biológicos específicos y a un pronóstico diferente (ver figura).
Mapa de la actividad de los factores de transcripción en los 1600 casos registrados. Cada color está asociado a un tipo de tumor preciso con mecanismos específicos.
Esta herramienta bioinformática, puesta a disposición de la comunidad científica y bautizada como GBM-cRegMap, tiene como objetivo determinar con precisión, a partir de datos moleculares individuales, las características del tumor al momento de su detección pero también después del tratamiento en caso de recaída. Datos valiosos para entender mejor los mecanismos del glioblastoma y su evolución, así como para el desarrollo de terapias más personalizadas.
Este mapa también revela que los modelos preclínicos actuales (modelos celulares que simulan el tumor y permiten probar nuevas terapias) en realidad no responderían a todos los tipos de tumores identificados, destacando la necesidad de desarrollar nuevas líneas celulares.
Fuente: Inserm